为做好2013年营业税改征增值税试点情况专项调查，上海专员办积极制定实施方案，采取日常跟踪、抽样检查、重点调研三者有机结合的方法，分阶段有序开展，突出“检查”和“研究”两条主线，力争摸清已有政策实施情况并对政策制定提出参考性建议。
第一步，建立营改增企业动态跟踪机制。
拟建立100户典型企业数据库，对试点方案确定的“1+6”行业及其子行业实现全覆盖。在机制上，一是确立内部跟踪调查机制，安排专人负责每月跟踪企业数据采集和分析，形成快报制度，按月汇报全市营改增政策执行情况、跟踪企业税负变动情况及其与经营状况的关系、执行中存在的主要问题以及当地出台的财税扶持政策等，重要情况随时上报。二是要形成对外长效沟通机制，联系市税务局共同做好选户工作，联系市税务局和财政局按月提供全市试点工作开展情况和财政补贴政策执行情况基本数据，联系人民银行国库部门调查试点行业增值税入库情况。
第二步，结合税收征管质量检查开展营改增专题抽样检查。
重点关注试点税务政策执行中，税务部门征收管理情况；企业试点后，增值税缴纳和抵扣情况、增值税专用发票开票情况以及会计核算情况；地方相关财政扶持政策情况；税款入库情况等。
第三步，以“评估+探索”方式对重点企业开展调研。
“评估”是指对运行满一年的营改增试点方案进行阶段性评估，分析收益效果、突出典型事例。一是评估整体效益，分析营改增实际带来的税制健全、结构性减税、经济结构调整等作用，尤其关注到对服务业发展趋势和结构的影响，以及对地方财政和地方财力的影响。二是关注对不同纳税人的影响，包括对试点一般纳税人的税负评估，对原增值税一般纳税人的减税效果，以及对小规模纳税人的税负影响。三是突出典型事例。“探索”是对尚未列入营改增方案的邮电通信业、铁路运输业进行前期的探索性研究。一是直接影响预估。对邮电通信、铁路运输企业本身进行调研，走访上海移动、上海电信、上海联通三大电信运营商和上海铁路局及其下属企业，收集实时数据进行模拟测试，查看试点税率下，企业税负变化情况，同时宣传政策，提前掌握两行业试点可能出现的问题。二是下游影响预估。对列入专员办跟踪名单的其他企业进行有重点的数据收集，查看邮电通信、铁路运输费用在企业成本中的构成，估算试点推开后，对现有企业的减税程度。
