企业购进免税农产品，其账务处理与国内购进货物基本相同，主要区别在于由于购进的是初级产品，直接从农业生产者那里购进，无法取得增值税专用发票，其进项税额根据购进的免税农产品的买价和1000的扣除率计算确定。企业购进免税农产品时，根据买价和规定的扣除率计算的进项税额，借记“应交税金—应交增值税（进项税额）”账户，按买价扣除按规定计算的进项税额后的数额，借记“物资采购”、“库存商品”等账户，按应付或实际支付的价款，贷记“银行存款”或“应付账款”等账户。
例如，红星公司2004年1月12日购进玫瑰花一批，以银行存款支付买价25 000元。则会计处理如下：
借：物资采购 22 500
应交税金——应交增值税（进项税额） 2 500
贷：银行存款 25 000