全部资产减去全部负债后的差额，包括事业基金、固定基金、专用基金、财政补助结存、拨入专款结存和款分配结余等。
分类 按净资产的经济内容分类一般可以分为固定基金、事业基金、专用基金、财政补助结存、拨入专款结存和未分配结余等。按是否限定用途分类可以分为限定用途的净资产和非限定用途的净资产两种：限定用途的净资产是指单位自有的由资财提供者提供或单位按规定形成的具有限制性用途的净资产，如单位获得的具有特定用途的受赠财产、按规定办法建立或形成的专用基金等；非限定用途的净资产是指单位自有的由资财提供者提供或单位按规定形成的无限制性用途的净资产，如国家财政或上级单位对单位的科学事业费拨款结存、损赠人对单位无限制性使用的资财损赠结存、单位按规定由结余分配转入的无限定用途的一般基金等。
事业基金 单位拥用的非限定用途的净资产，既包括滚存结余资金，也包括单位因对投资而形成的投资基金等。滚存结余资金实际上是由单位历外非限定用途资金累计收支余额结转形成，《科学事业单位会计制度》将其规定为一般基金。一般基金主要有两种形成渠道，一是单位事业收支结余分配后转入，二是单位经营收支结余分配后转入。单位的事业结余和经营结余都应按规定顺序进行分配。其中，事业结余按规定提取职工福利基金后的余额全部转为单位的事业基金；经营结余按有关规定在税前弥补经营收支差额并按规定顺序提取科技成果转化基金和职工福利基金后的余额全部转为单位的事业基金。事业基金主要用于弥补单位事业收支差额。投资基金产单位因进行投资划定的事业基金部分。
固定基金 单位固定资产所占用的资金。既可以反映固定资产所占用的资金，又可以对事业基金进行调整。但固定基金同固定资产一样，既不反映固定资产的原始价值，也不反映固定资产的净值，而是反映形成固定资产的历史成本。
专用基金 单位按规定提取或设置的具有专门用途的资金。根据国家预算管理的要求，不同的资金有不同的使用规定。作为专用基金进行管理的资金主要包括修购基金、职工福利基金、医疗基金、住房基金、科技成果转化基金、其他基金等。
财政补助结存 单位在主管部门及代行拨款职能的单位期末应拨未拨的财政资金结存及单位从财政部门和财务主管部门取得并需结转下年继续使用的财政资金结存。就单位的主管部门及代行拨款职能的单位而言，财政补助结存是期末应拨未拨的财政资金结存；就基层单位而言，财政补助结存是单位从财政部门和财务主管部门取得需要结转下年继续使用的财政资金结存。
拨入专款结存 单位的主管部门及代行拨款职能的单位期末待转拨的专项资金结存及单位从财政部门和财务主管部门取得并需结转下年继续使用的专项资金结存。就单位的主管部门及代行拨款职能的单位而言，拨入专款结存是期应拨未拨的专项资金结存；就基层单位而言，拨入专款结存是科学事业单位取得的拨入专款中由于项目未完成、需结转下年继续使用而在期末形成的结存。
