随着国家对教育的重视，巴楚县紧紧围绕“教育优先发展”的主题，始终以办好人民满意的教育为出发点，以提高全县各族人民的素质为目标，大力实施“科教兴县”战略。近年来，该县通过优先保障教育发展，深入落实农村义务教育经费保障机制改革，进一步提高农村中小学公用经费水平，足额保障教育事业经费，加大教育基础设施建设，取得了教育工作的新突破。

　　该县在加大教育投入的同时，积极申请国家教育项目的支持，2001—2008年先后实施了国家二期贫困地区义教工程项目、国家农村寄宿制学校建设工程项目、中小学危房改造项目、中小学远程教育项目工程、D级危房改造项目。共投入校舍改造资金4970万元，完成改造校舍56419平方米，其中：利用国家二期贫困地区义教工程项目资金2164万元，完成校舍建筑面积21497平方米，新建了县三中、四中、恰尔巴格乡中学、多来提巴格乡中学、阿纳库勒乡中学、阿纳库勒乡中心小学教学用房，配备了必备教学设备；利用国家寄宿制学校建设工程项目资金2253万元，完成校舍建筑面积27790平方米，新建了县四中、五小、多来提巴格乡中学、阿纳库勒乡中学、夏马勒乡中学、新城小学校舍；利用国家中小学危房改造项目资金156万元，完成农村学校2100平方米校舍改造；利用国家远程教育工程项目资金308万元，对全县80所农村中小学远程教育工程进行全面建设；利用国家D级危房改造资金397万元，消除了所有学校5032平方米D级危房。