新《企业所得税法实施条例》第十条规定：企业所得税法第五条所称亏损，是指企业依照企业所得税法和本条例的规定将每一纳税年度的收入总额减除不征税收入、免税收入和各项扣除后小于零的数额。《中华人民共和国企业所得税法》（中华人民共和国主席令第63号）第十八条规定：“企业纳税年度发生的亏损，准予向以后年度结转，用以后年度的所得弥补，但结转年限最长不得超过五年。”
根据国税发[1997]189号文件规定，“税法所指亏损的概念，不是企业财务报表中所反映的亏损额，而是企业财务报表中的亏损额经主管税务机关按税法规定调整后的金额。”这里的“五年”，是指税收上计算弥补亏损的期限，只对计算应纳税所得额产生影响，而在弥补亏损的会计核算中，并不受“五年”期限的限制。会计上，无论是盈利还是亏损，期末一律将“本年利润”科目的余额，结转“利润分配-未分配利润”科目。这里的“本年利润”余额是指扣除所得税费用后的净利润。
企业弥补亏损的方式：1．企业发生亏损，可以用次年度的税前利润弥补，次年度利润不足弥补的，可以在5年内延续弥补。2．企业发生的亏损，5年内的税前利润不足弥补时，用税后利润弥补。这种方式不确认递延所得税。税法上在计算应税所得时不能扣除亏损余额。3．企业发生的亏损，可以用盈余公积弥补。借记“盈余公积” 科目，贷记“利润分配——盈余公积补亏” 科目。
几种特殊情况下亏损的弥补方法
1.分立（兼并、股权重组）亏损弥补
国家税务总局《关于印发〈企业所得税税前弥补亏损审核管理办法〉的通知》（国税发[1997]189号）规定，1.企业分立前尚未弥补的经营亏损，根据分立协议约定由分立后的各企业负担的数额，按税收法规规定的弥补年限，在剩余期限内，由分立后的各企业逐年延续弥补。2.被兼并企业尚未弥补的经营亏损，区别不同情况处理：①被兼并企业在被兼并后继续具有独立纳税人资格的，其兼并前尚未弥补的经营亏损，在税法规定的期限内，由其以后年度的所得逐年延续弥补，不得用兼并企业的所得弥补；②被兼并企业在被兼并后不具有独立纳税人资格的，其兼并前尚未弥补的经营亏损，在税法规定的期限内，可由兼并企业用以后年度的所得逐年延续弥补。3.企业进行股权重组，在股权转让前尚未弥补的经营亏损，可按税法规定的弥补年限，在剩余期限内，由股权重组后的企业逐年延续弥补。
2.免税所得弥补亏损
国家税务总局《关于企业的免税所得弥补亏损问题的通知》（国税发[1999]34号）规定，如果一个企业既有应税项目，又有免税项目，其应税项目发生亏损时，按照税收法规规定可以结转以后年度弥补的亏损，应该是冲抵免税项目所得后的余额。此外，虽然应税项目有所得，但不足弥补以前年度亏损的，免税项目的所得也应用于弥补以前年度亏损。
3.汇总纳税企业的弥补亏损
国家税务总局《关于进一步加强汇总纳税企业所得税管理的通知》（国税发[2000]185号）明确规定，汇总纳税企业汇总后为亏损的，其亏损额由总机构用以后年度的汇总所得按规定弥补，汇总纳税企业取消汇总纳税后，其以前年度汇总尚未弥补的亏损额，经主管税务机关审核确认后，报经国家税务总局批准，可按照各亏损成员企业以前年度发生亏损额的比例进行分解。成员企业按分解的亏损额，在规定的剩余期限内结转弥补。
国税发[1997]189号文件规定，经国家税务总局批准实行由行业和集团公司汇总、合并缴纳企业所得税的成员企业（单位）当年发生亏损，在汇总、合并纳税时已冲抵了其他成员企业（单位）的所得额或者并入了母公司的亏损额，发生亏损的成员企业（单位）不得用本企业（单位）以后年度实现的所得弥补。成员企业（单位）在汇总、合并纳税年度以前发生的亏损可按税法规定，用本企业（单位）以后年度的所得予以弥补，不得并入母（总）公司的亏损额，也不得冲抵其他成员企业（单位）的所得额。
4.股权投资亏损弥补
国家税务总局《关于企业股权投资业务若干所得税问题的通知》（国税发[2000]118号）规定，被投资企业发生的经营亏损，由被投资企业按规定结转弥补；投资方企业不得调减其投资成本，也不得确认投资损失。企业因收回、转让或清算处置股权投资而发生的股权投资损失，可以在税前扣除，但每一纳税年度扣除的股权投资损失，不得超过当年实现的股权投资收益和投资转让所得，超过部分可无限期向以后纳税年度结转扣除。