查账与审计的关系十分密切。查账是审计的重要手段，审计是查账技术得以发挥作用的重要领域。很多审计项目都是通过查账手段，发现线索，使问题得以揭露的。所以，审计离不开查账，但查账与审计又有区别。首先，查账与审计的主体不同。审计的主体是独立的专业人员，他必须地位超脱，是与委托人和被查对象无任何利害关系的第三者，他具有独立性和权威性；而查账则不同，它可以由企业的会计人员、稽核人员，或财政、税务、银行等经济监督机构人员执行，他们受所从事的专业性质限制，不能像审计人员那样超脱，因而独立性权威性较差。其次，审计与查账的范围不同，审计是对被审单位经济活动的全面审查，不仅包括会计的账簿、凭证，还包括企业的内部控制制度的制定、人员分工情况等；而查账仅限于会计的账簿、凭证，范围要比审计窄。再次，查账与审计作用不同。审计不仅仅反映经济活动的真实性、合法性、有效性与可行性，而且还对被审查单位经济活动和经济效益进行鉴证；通过查账可以查证被审单位会计资料的真实性、合法性，促进被审单位建立完善的内控机制，加强会计基础工作，维护财经纪律。
稽核主要是在企业内部或本系统内部进行。通过检查会计账簿对不正确的地方予以纠正。稽核可以保证企业会计账簿的完整、正确，使本企业或系统外的查账和审计单位少发现错误。稽核工作通常的手段也是查账，通过查账发现问题，及时地解决问题。但查账既可以由内部人员执行，又可以由外部人员执行，但外部人员通过查账找出问题不如内部稽核及时、便捷。外部查账在查账之后通常要写查账报告，具体写明查账结果，客观地督促企业执行，而稽核发现的问题，只需及时通知有关人员执行，不用出具报告。
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