所得税汇算实际上是对单位全部纳税情况的一次全面检查。所得税检查既查纳税情况，又涉及公司的财务管理、财务核算等，政策性强、涉及面广、工作量大。人们常说：“凡事预则立，不预则废”。做好汇算清缴前的准备工作，在申报中有的放矢，才能事半功倍。
一、全面了解单位的基本情况是搞好企业所得税汇算检查的基础
企业所得税汇算涉及单位生产经营的各个环节，了解单位全貌将有助于全面掌握单位的基本情况。主要了解单位的经营历史，经营状况、业务类型、经营现状、主要业务及主要的销货方、供货方，各类资产的形式、主要存放地，单位职工概况，总体文化程度，企业文化等。
二、详细阅读研究年度财务会计报表、财务说明、企业所得税申报表，并与以前年度比对，是搞好企业所得税汇算的关键
单位年度财务会计报表、财务说明和单位年度所得税申报表是对单位全年经营情况的总体反映，是单位经营成果的集中体现。要了解被查单位与税收相关的财务指标，重点了解一些重要的财务指标，既包括绝对数指标，也包括相对数指标，发现其中的差异，作为检查的重点，如：销售收入利润率（税前利润/销售收入*100%）、生产成本销售率（销售收入/生产成本*100%）、固定资产缴纳房产税率（已缴房产税/固定资产总额*100%）等涉税指标，将这些指标与单位历史数据、当期同行业平均水平进行比较，如出现大起大落、或长期始终保持一个比较稳定的数值，则有深查的必要。
三、对有关的税收法律、法规、规章和相关财务会计知识的学习是搞好企业所得税汇算的重点
“磨刀不误砍柴工”。对涉及单位有关的税收政策进行全面系统的学习掌握，对单位应缴税种、适用的税目、税率，如何确定计税依据等，要做到政策清楚、条款熟悉，全面熟悉掌握涉及单位相关的税收法律、法规、规章等。针对单位的经营特点组织组成员学习相关的财务会计知识，以提高检查的有效性和针对性。如行政许可法实施后，取消部分行政审批，由被查单位自行提取费用、税前弥补等。
四、与单位的税务管理员、调阅单位的历史检查材料和审计报告、与财务人员及其他有关人员作深入交流，是搞好企业所得税汇算的必经程序
通过与单位的税务管理员进行交流，可能发现问题，估计单位可能出现的问题。特别行业的有关税收共性问题，行业其他单位的税收理解。
单位的历史检查资料较为全面地反映了税务机关在历年的税务检查中已发现的问题，了解单位历年查出的问题，从而确定单位目前仍然可能存在的问题。特别是稽查局稽查的结论，还应查阅会计师事务所的审计报告和内部审计的审计报千，对上述资料应进行详细的阅读，上面载明了历年检查中的详细情况，而内审报告则从内审的角度说明单位本身存在的一些基本情况，会计师事务所的审计报告则从更加专业、全面如实反映单位的资产、经营及结果的角度进行反映，从中发现单位可能存在的问题。
重点详细了解单位财务核算流程，从单位财务核流程中发现可能存在的问题，了解单位的财务会计核办法，对在当年度有特殊财务处理或意外情况发生应重点向财务人员加以了解情况等。如：单位改制、折旧办法的改变、各类减值准备的计提以及各类税款的计税依据的确定、税种、税目、税率的适用等。
根据单位经营规模的大小、经营业务的复杂状况、财务处理的复杂程度等来决定简化相应的企业所得税汇算检查前的准备工作。