（1）普通发票真伪鉴别方法。
发票监制章是识别发票真伪的重要法定标志。全国统一启用的新版发票“发票监制章”，其形状为椭圆形，上环刻制“全国统一发票监制章”字样，下环刻制“**税务局监制”字样，中间刻制国税、地税机关所在的省、市全称或简称，字体为正楷，印色为大红色，紫外线灯下，呈桔黄色，荧光反映，套印在发票联的票头正中央。从发票联采用有“SW”字样防伪专用纸等方面识别，用发票防伪鉴别仪器识别防伪油墨看其是否是统一的防伪油墨。这些防伪措施也是识别发票真伪的重要依据。
（2）增值税专用发票真伪鉴别方法。
为鉴别增值税专用发票的真伪，首先应了解其防伪措施，然后采取特定的审查方法来鉴别其真伪。对照光线审查增值税专用发票的发票联和抵扣联，看是否使用国家税务总局统一规定带有水印图案的防伪专用纸印制。用紫外线灯、发票鉴别仪鉴别无色和有色荧光防伪标“SW”。
（3）对照审查发票法。
将用票单位发票的实际使用情况，与《发票购领簿》及发票领用存的情况核对，审查私印发票、丢失发票、转借发票、虚开发票、代开发票、使用作废发票和超经营范围填开发票的问题。
（4）票面逻辑推理法。
根据发票各个栏目所列的内容之间、发票与用票单位有关经济业务之间的关系进行分析审核，从中发现问题。发票所列各项内容之间，有其内在的逻辑关系和规律性，如果违背了这些规律，就说明发票存在问题。如增值税专用发票中购销双方的名称与税务登记号有着直接的对应关系；根据销售货物或劳务的名称可以确定适用税率；根据计量单价、数量、单位、金额、税率和税额之间的逻辑关系可以推断金额和税额的计算有无错误等。
（5）联系实务法。
发票与企业的购销业务有着直接的联系，而购销业务与企业存货数量及货币资金（包括债权、债务)的增减变化有着一定的对应关系，利用这一逻辑关系就可以审查发票使用有无问题。取得发票的金额与存货、费用增加额，货币资金减少额，流动负债增加额等呈同步变化趋势；填开发票的金额与存货减少额，货币资金或应收债权增加额等呈同步变化趋势。如果企业取得和填开的发票与购销业务之间的关系违背了上述规律，就有可能存在问题，需要进一步审查核实。