◆污染物排放未达到排放标准，取消增值税退免税资格，三年内不得再次申请。
◆不符合资源综合利用企业所得税优惠条件，不能享受减免税。
◆未按规定在税务机关登记备案的，一律不得减免税。
◆减免税备案手续不齐全，不能享受增值税减免税。
◆未按规定备案的，不得享受企业所得税优惠。
◆未分别核算优惠与非优惠项目的，不能享受减免税。
增值税方面
风险提示：污染物排放未达到排放标准，取消享受资源综合利用产品及劳务增值税退税、免税政策资格，且三年内不得再次申请。
政策依据
《财政部、国家税务总局关于享受资源综合利用增值税优惠政策的纳税人执行污染物排放标准有关问题的通知》（财税〔2013〕23号）
要点提示：
★自2013年4月1日起，纳税人享受资源综合利用产品及劳务增值税退税、免税政策的，其污染物排放必须达到相应的污染物排放标准。
★纳税人在办理资源综合利用产品及劳务增值税退税、免税事宜时，应同时提交污染物排放地环境保护部门确定的该纳税人应予执行的污染物排放标准，以及污染物排放地环境保护部门在此前6个月以内出具的该纳税人的污染物排放符合上述标准的证明材料。已开展环保核查的行业，应以环境保护部门发布的符合环保法律法规要求的企业名单公告作为证明材料。
★对未达到相应的污染物排放标准的纳税人，自发生违规排放行为之日起，取消其享受资源综合利用产品及劳务增值税退税、免税政策的资格，且三年内不得再次申请。纳税人自发生违规排放行为之日起已申请并办理退税、免税的，应予追缴。
企业所得税方面
风险提示：不符合资源综合利用企业所得税优惠条件，不能享受减免税。
政策依据
《国家税务总局关于资源综合利用企业所得税优惠管理问题的通知》（国税函〔2009〕185号）
要点提示：
★本通知所称资源综合利用企业所得税优惠，指企业自2008年1月1日起以《资源综合利用企业所得税优惠目录（2008年版）》（以下简称《目录》）规定的资源作为主要原材料，生产国家非限制和非禁止并符合国家及行业相关标准的产品取得的收入，减按90%计入企业当年收入总额。
★经资源综合利用主管部门按《目录》规定认定的生产资源综合利用产品的企业（不包括仅对资源综合利用工艺和技术进行认定的企业），取得《资源综合利用认定证书》，可按本通知规定申请享受资源综合利用企业所得税优惠。
★企业从事非资源综合利用项目取得的收入与生产资源综合利用产品取得的收入没有分开核算的，不得享受资源综合利用企业所得税优惠。企业实际经营情况不符合《目录》规定条件，采用欺骗等手段获取企业所得税优惠，或者因经营状况发生变化而不符合享受优惠条件，但未及时向主管税务机关报告的，按照税收征管法及其实施细则的有关规定进行处理。
核算方面
风险提示：未分别核算优惠与非优惠项目的，不能享受减免税。
政策依据
《国家税务总局关于印发〈税收减免管理办法（试行）〉的通知》（国税发〔2005〕129号）
要点提示：
★纳税人同时从事减免项目与非减免项目的，应分别核算，独立计算减免项目的计税依据以及减免税额度。不能分别核算的，不能享受减免税；核算不清的，由税务机关按合理方法核定。
备案方面
风险提示一：未按规定在税务机关登记备案的，一律不得减免税。
政策依据
《国家税务总局关于印发〈税收减免管理办法（试行）〉的通知》（国税发〔2005〕129号）
要点提示：
★减免税分为报批类减免税和备案类减免税。报批类减免税，指应由税务机关审批的减免税项目；备案类减免税，指取消审批手续的减免税项目和不需税务机关审批的减免税项目。
★纳税人享受报批类减免税，应提交相应资料，提出申请，经按本办法规定具有审批权限的税务机关（以下简称有权税务机关）审批确认后执行。未按规定申请或虽申请但未经有权税务机关审批确认的，纳税人不得享受减免税。
★纳税人享受备案类减免税，应提请备案，经税务机关登记备案后，自登记备案之日起执行。纳税人未按规定备案的，一律不得减免税。另外，如果备案资料中没有资源综合利用认定证书，也不得减免税。
风险提示二：减免税备案手续不齐全，不能享受增值税减免税。
政策依据
《财政部、国家税务总局关于调整完善资源综合利用产品及劳务增值税政策的通知》（财税〔2011〕115号）
要点提示：
申请享受资源综合利用产品及劳务增值税优惠政策的纳税人，应符合的条件还有：
★纳税人生产、利用资源综合利用产品及劳务的建设项目已按照《中华人民共和国环境影响评价法》编制环境影响评价文件，且已获得经法律规定的审批部门批准同意。
★自2010年1月1日起，纳税人未因违反《中华人民共和国环境保护法》等环境保护法律法规受到刑事处罚或者县级以上环保部门相应的行政处罚。
★申请享受资源综合利用产品，已送交由省级以上质量技术监督部门资质认定的产品质量检验机构进行质量检验，并已取得该机构出具的符合产品质量标准要求及本文件规定的生产工艺要求的检测报告。
★申请享受本通知规定的资源综合利用产品及劳务增值税优惠政策的，应当在初次申请时按照要求提交资源综合利用产品及劳务有关数据，报主管税务机关审核备案，并在以后每年2月15日前按照要求提交上一年度资源综合利用产品及劳务有关数据，报主管税务机关审核备案。具体数据要求和提交办法由财政部和国家税务总局另行通知。
风险提示三：未按规定备案的，不得享受企业所得税优惠。
政策依据
《国家税务总局关于企业所得税税收优惠管理问题的补充通知》（国税函〔2009〕255号）
要点提示：
★列入企业所得税优惠管理的各类企业所得税优惠，包括免税收入、定期减免税、优惠税率、加计扣除、抵扣应纳税所得额、加速折旧、减计收入、税额抵免和其他专项优惠政策。除国务院明确的企业所得税过渡类优惠政策、执行企业所得税法后继续保留执行的原企业所得税优惠政策、企业所得税法第二十九条规定的民族自治地方企业减免税优惠政策，以及国务院另行规定实行审批管理的企业所得税优惠政策外，其他各类企业所得税优惠政策，均实行备案管理。
★对需要事先向税务机关备案而未按规定备案的，纳税人不得享受税收优惠；经税务机关审核不符合税收优惠条件的，税务机关应书面通知纳税人不得享受税收优惠。
★列入事后报送相关资料的税收优惠，纳税人应按照企业所得税法及其实施条例和其他有关税收规定，在年度纳税申报时附报相关资料，主管税务机关审核后如发现其不符合享受税收优惠政策的条件，应取消其自行享受的税收优惠，并相应追缴税款。
