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当公司收到投资款时，应该按照以下步骤确认会计科目：
1. 首先，将收到的投资款记录在公司的现金账户中，确认现金账户的借方科目。
2. 接着，将投资款确认为公司的股东权益，确认股东权益的贷方科目。

具体来说，如果投资款是用于发行股票，那么应该将投资款确认为股本；如果投资款是用于购买公司资产或支付公司债务，那么应该将投资款确认为资本公积或其他应付款。

需要注意的是，如果投资款是预收款或定金，那么应该将其确认为预收账款或预收款项，而不是股东权益。在后续交付产品或服务时，再将预收账款转化为收入。