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如果发现年报纳税总额填报错误，应当及时进行修正。具体操作如下：
1. 首先，需要准备好修正所需的材料，包括纳税申报表、税务机关出具的税务处理通知书、税务机关出具的税务调查通知书等相关文件。
2. 在税务局网站上下载《企业所得税年度纳税申报表》（A表）和《企业所得税年度纳税申报表》（B表）。
3. 对于填报错误的年报纳税总额，需要在A表的第46行和B表的第39行进行修正。
4. 根据实际情况填写修正后的纳税申报表，并在表格上注明“修正”。
5. 将修正后的纳税申报表和相关材料提交给税务机关进行审核。
6. 税务机关审核通过后，会重新计算企业的纳税总额并出具税务处理通知书。

需要注意的是，企业在修正年报纳税总额时，应当及时向税务机关说明情况，积极配合税务机关的工作，遵守税务法规，确保纳税申报的准确性和合法性。