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小规模纳税人增值税纳税申报表中的其他扣除项目包括：
1. 纳税期内应税销售额为零的纳税人，可以在其他扣除项目中填写上期留抵税额。
2. 纳税期内发生的固定资产、无形资产和长期待摊费用的折旧、摊销和扣除。
3. 纳税期内发生的利息、租金、版权使用费等费用的扣除。
4. 纳税期内购进的固定资产、无形资产和长期待摊费用的进项税额。
5. 纳税期内发生的其他扣除项目，如住房公积金、社保费用等。

填写其他扣除项目时，需要在申报表中相应的栏目中填写具体的扣除项目名称和金额，并注明税率、税额等信息。同时，应保留好相关的凭证和票据，以备税务机关查验。