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行政事业单位会计科目表中的“专用基金”科目是用于记录该单位收入和支出的特定基金，其作用主要有以下几点：
1. 区分不同用途：专用基金科目可以将不同用途的资金分别记录，避免混淆，方便管理。
2. 管理专项资金：专用基金科目可以管理专项资金，确保专项资金的使用符合规定，避免乱用或挪用。
3. 控制支出：专用基金科目可以控制支出，避免超支或不当使用，保证资金的有效利用。
4. 监督审计：专用基金科目可以方便监督审计，确保财务报表的真实性和准确性。

总之，专用基金科目是行政事业单位财务管理的重要工具，可以帮助单位更好地管理资金，确保资金的合理使用和保障单位的正常运转。