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在建工程是指企业正在建设或改造的工程项目，其二级科目包括：
1. 在建工程-建筑工程：包括建筑物、构筑物、道路、桥梁、隧道、地下工程、水利工程等建筑工程项目。
2. 在建工程-机械设备安装工程：包括机械设备的安装、调试、试运行等工程项目。
3. 在建工程-电气安装工程：包括电气设备的安装、调试、试运行等工程项目。
4. 在建工程-装修装饰工程：包括室内装修、装饰、翻新等工程项目。
5. 在建工程-其他工程：包括其他类型的在建工程项目。

以上是常见的在建工程二级科目，具体的科目设置还需根据企业实际情况进行调整。