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首先，需要确定这笔奖金是以什么形式发放的。如果是公司直接发放的奖金，那么应该按照个人所得税法的规定，从奖金中扣除应纳税所得额的个人所得税。

根据个人所得税法，应纳税所得额=奖金-个人所得税起征点(5000元/月)。假设这位员工的月薪为1万元，那么他的个人所得税起征点为5000元/月，年度为6万元。因此，这笔6万元的奖金需要扣除的个人所得税应该是：

应纳税所得额 = 6万元 - 6万元/12个月 × 5000元/月 = 3万元

根据个人所得税税率表，3万元的应纳税所得额对应的税率是10%，应缴纳的个人所得税为：

个人所得税 = 3万元 × 10% - 210元(速算扣除数) = 2790元

因此，这位员工需要缴纳2790元的个人所得税。