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工程施工下设的二级科目可以根据具体情况而定，以下是一些常见的二级科目：
1. 施工成本类：人工费、材料费、机械使用费、施工保险费、施工安全费等。
2. 工程管理类：工程管理费、监理费、设计费、招标代理费、工程咨询费等。
3. 费用支出类：水电费、通讯费、差旅费、招待费、办公费等。
4. 税费类：土地增值税、城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加等。
5. 其他类：折旧费、维修费、租赁费、保险费、损失减少等。

需要注意的是，不同的工程项目可能会存在一些特殊的二级科目，需要根据具体情况进行设置。