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如果进项已抵扣并且已经开出了发票，但是后来需要进行冲红处理，那么需要按照以下步骤进行会计处理：
1. 首先，需要将原来的进项发票进行作废处理，同时将抵扣的进项税额进行冲减。
2. 然后，需要重新开具一张红字发票，将之前抵扣的进项税额进行冲抵，同时将原来的发票号码和开票日期等信息填写在红字发票上。
3. 最后，将新开的红字发票进行记账处理，将冲抵的进项税额重新计入应交税金科目。

需要注意的是，对于已经抵扣的进项税额，如果发生了冲红处理，那么需要及时进行会计处理，避免对公司的财务造成影响。