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个人所得税应纳税额计算公式中的扣除项包括以下几个：
1. 起征点扣除：根据国家规定，个人月收入超过3500元的部分需要缴纳个人所得税。起征点是指个人月收入达到3500元后，再扣除一定金额后再计算个人所得税。
2. 专项扣除：个人可以根据自己的实际情况享受一些专项扣除，如子女教育、住房租金、赡养老人、继续教育等。这些扣除项可以减少个人应缴纳的个人所得税。
3. 捐赠扣除：个人在一定范围内的慈善捐赠可以享受一定的税前扣除。
4. 补充医疗保险扣除：个人参加补充医疗保险可以享受一定的税前扣除。

需要注意的是，以上扣除项的具体金额和范围都需要根据国家相关规定进行计算和申报。