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民间非营利组织（以下简称“非营利组织”）在进行投资活动时，应该根据投资的性质和目的，选择合适的会计处理方法。一般来说，非营利组织的投资款项主要分为以下两类：
1. 长期投资款：非营利组织以长期持有为目的的投资款项，如购买股票、债券、基金等，应该按照“长期投资”科目进行核算。具体会计处理方法如下：
（1）购买时，应该以实际支付的金额计入长期投资账户；
（2）持有期间，应该按照公允价值法或成本法进行估值，并及时调整账面价值；
（3）出售时，应该以实际收到的金额扣除相关费用后计入投资收益。
2. 短期投资款：非营利组织以短期持有为目的的投资款项，如短期理财产品、货币市场基金等，应该按照“短期投资”科目进行核算。具体会计处理方法如下：
（1）购买时，应该以实际支付的金额计入短期投资账户；
（2）持有期间，应该按照公允价值法进行估值，并及时调整账面价值；
（3）到期时，应该按照实际收到的本息计入投资收益。

需要注意的是，非营利组织在进行投资时，应该遵循相关法律法规和组织章程的规定，并对投资风险进行合理评估和控制。同时，应该及时公示投资情况和投资收益情况，保证信息透明度。