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短期投资的会计科目应该设置为“短期投资”或“可供出售金融资产”科目。这些科目通常属于流动资产的范畴，用于记录公司所持有的短期投资，如股票、债券、货币市场基金等。

在会计报表中，短期投资通常会被列为资产负债表的一部分，以反映公司的投资组合和流动性。如果这些短期投资是可供出售的金融资产，那么它们的价值变动将会被记录在资产负债表之外的“其他综合收益”科目中。

需要注意的是，会计科目的设置应该根据公司的具体业务情况和会计准则进行调整。因此，具体的设置应该由会计师根据实际情况进行决定。