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不得抵扣的进项税额包括：与非货物销售相关的进项税、与免税项目相关的进项税、与不征税项目相关的进项税、与进口货物增值税专用缴款书相关的进项税、与固定资产购置税额不符合规定的进项税等。这些进项税额不能在销售商品或提供劳务时抵扣，但可以在纳税申报时列入成本或费用进行税前扣除。具体操作方法如下：
1. 在进项税额明细账中单独核算不得抵扣的进项税额。
2. 在纳税申报时，将不得抵扣的进项税额列入成本或费用进行税前扣除。
3. 在填写《增值税纳税申报表》时，将不得抵扣的进项税额填写在“应纳税额”栏下的“进项税额不可抵扣部分”栏。

需要注意的是，不得抵扣的进项税额不能作为减免税款的依据，也不能退税。因此，在进行纳税申报时，应当仔细核算和处理不得抵扣的进项税额。