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公司购买的厂房对厂房的装修费用应分别计入以下会计科目：
1. 厂房账户：购买厂房的成本应计入该科目，包括房屋本身的价值和购买时的相关费用（如中介费、印花税等）。
2. 装修费用账户：厂房装修的费用应计入该科目，包括设计、施工、材料等费用。

需要注意的是，装修费用应当根据实际情况进行分类。如果装修费用与厂房的购买价值相比较小，可以将其作为厂房的修缮费用计入厂房账户中；如果装修费用相对较大，可以将其单独计入装修费用账户中。同时，在计算折旧时，也应根据实际情况对厂房和装修费用进行分别计算。