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异地工程预缴税款的会计分录中，预缴税款的抵扣情况应该根据实际情况进行处理。

如果预缴的税款可以抵扣该企业在异地的应纳税款，则应按照以下会计分录进行处理：

借：应交税费（异地）账户
贷：银行存款账户

如果预缴的税款不能抵扣该企业在异地的应纳税款，则应按照以下会计分录进行处理：

借：工程施工成本账户
贷：应交税费（异地）账户

需要注意的是，如果预缴的税款不能在异地抵扣，但可以在其他地区抵扣，则应在其他地区的应交税费账户中进行处理。同时，在异地和其他地区的应交税费账户中都应记录相应的抵扣情况，以便于后续的税务核算和管理。