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补缴增值税的会计凭证编制和登记如下：
1. 首先，根据补缴增值税的金额，确定需要增加的应交税金科目。应交税金科目一般为负债类科目，可以根据实际情况选择适当的科目。
2. 编制会计凭证，一般包括借方和贷方两个方向。借方金额为应交税金科目的金额，贷方金额为补缴增值税的金额。
3. 在借方栏中，填写应交税金科目的科目代码和金额；在贷方栏中，填写增值税科目的科目代码和金额。
4. 在会计凭证的摘要栏中，简要说明补缴增值税的原因和金额。
5. 根据公司的会计制度，填写会计凭证的日期和凭证号码。
6. 将编制好的会计凭证送审，并经过负责人或会计主管的审批。
7. 审批通过后，将会计凭证录入到会计系统中，进行相应的账务处理。
8. 在会计系统中，根据会计凭证的内容，自动生成相应的会计科目的借贷方明细账，并及时进行核对和调整。
9. 定期进行会计核算和报表编制，将补缴增值税的相关信息纳入财务报表中。

以上是补缴增值税的会计凭证编制和登记的一般步骤，具体操作还需根据实际情况和公司的会计制度进行调整。建议在操作过程中，遵守相关会计准则和法律法规，并咨询专业会计师的意见。