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商品房买卖合同印花税的缴纳方式根据中国税法的规定，一般有两种方式：
1. 一次性缴纳：根据合同签订时的房屋总价，按照印花税税率进行计算，一次性缴纳给税务机关。一般情况下，印花税的税率为1%。
2. 分期缴纳：根据合同约定的付款方式，将印花税按照分期付款的进度进行缴纳。例如，如果合同约定首付款为30%，那么可以按照30%的房屋总价计算印花税，然后在首付款支付时缴纳给税务机关；剩余的房款可以按照合同约定的分期付款进度进行缴纳相应的印花税。

无论是一次性缴纳还是分期缴纳，都需要在签订合同时就按照税法规定的期限向税务机关申报并缴纳印花税。同时，需要注意的是，如果购买商品房的一方是企事业单位或个体工商户，还需要在购房合同签订后30天内向税务机关申请印花税的减免。