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增值税专用发票开具红字发票的申请流程分为三步：红字信息表填开、接收校验通过信息表、销售方开具红字发票。纳税人可以通过金税盘或税控盘两种开票系统进行申请操作。 第一步：填开并上传《增值税专用发票红字信息表》 两种申请方式：购买方申请和销售方申请。 1、购买方申请 (1)购买方取得专票已抵扣情形： 购买方在增值税发票管理新系统中填开并上传《红字信息表》，在填开《红字信息表》时不填写相对应的蓝字专用发票信息。 购买方在当期申报时依据《红字信息表》所列增值税税额从当期进项税额中转出，待取得销售方开具的红字专用发票后，与《红字信息表》一并作为记账凭证。 注意：购买方已经抵扣进项发票的选择【已抵扣】;购买方于非申报期已认证通过但是未申报抵扣进项发票的，依然是选择【已抵扣】，待申报期时需要申报抵扣该笔进项税额。 (2)购买方取得专票未申报抵扣情形： 购买方取得专用发票未申报抵扣，且发票联或抵扣联无法退回的，购买方可在开票系统中填开并上传《红字信息表》，填开《红字信息表》时应填写对应的蓝字专用发票信息。 注意：购买方未申报抵扣进项发票的选择【未抵扣】。 2、销售方申请 销售方开具专用发票尚未交付购买方，以及购买方未用于申报抵扣并将发票联及抵扣联退回的，销售方可在开票系统中填开并上传《红字信息表》，销售方填开《红字信息表》时应填写相对应的蓝字专用发票信息。 第二步：接收校验通过信息表 主管税务机关通过网络接收纳税人上传的《红字信息表》，系统自动校验通过后，生成带有“红字发票信息表编码”的《红字信息表》，并将信息同步至纳税人端系统中。 纳税人也可凭《红字信息表》电子发票信息或纸质资料到税务机关对《红字信息表》内容进行系统校验。 特别提醒：填错的信息表未上传时，可直接在开票系统中作废;一旦上传成功，纳税人端便不能修改或撤销。应凭已开具《开具红字增值税专用发票信息表》全部联次和《作废红字发票信息表申请表》(加盖公章)到办税服务厅办理信息表的作废。 第三步：开具红字专用发票 销售方凭税务机关系统校验通过的《红字信息表》开具红字专用发票，在新系统中以销项负数开具，红字专用发票应与《红字信息表》一一对应。 特别提醒：没有上传成功的信息表可以重复进行上传，上传成功也审核通过的信息表，没有开具负数发票的前提下可以重新下载。 3、小规模纳税人代开的专用发票，如何开具红字？ 税务机关为小规模纳税人代开专用发票，需要开具红字专用发票的，按照一般纳税人开具红字专用发票的方法处理。纳税人请携带已开具发票各联次、开具红字发票的书面证明材料、经办人身份证明(经办人变更的还需提供复印件)，到税务机关窗口办理。 4、开具红字增值税普通发票特别提醒 纳税人需要开具红字增值税普通发票的，销售方必须收回原发票并注明“作废”字样或取得对方有效证明，通过开票系统开具对应红字发票。 提示：可以在所对应的蓝字发票金额范围内开具多份红字发票。 电子发票系统不支持作废操作，发生退货、电子发票开具有误等情况，开票人应通过开具红字发票进行冲减。电子发票开具红字发票，需要与对应的物流、资金流信息一致。