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分公司应该汇总到总公司后申报企业所得税，但涉及纳税所属地问题，以及事关各地主管税务机关的任务目标，情况有点复杂。一般来说是，就地预缴，集中清算。 具体说明如下： 首先，必须明确，该独立核算的分公司企业是否确实具有法人资格，这点可以从该公司的营业执照上获取信息。从理论上说，分公司是指在业务、资金、人事等方面受总公司管辖而不具有法人资格的分支机构，在法律上、经济上没有独立性，没有自己的名称、章程，也没有自己的财产，并以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任。 情况一、如果确实是分公司，一般说来，应当通过总公司汇总申报并缴纳企业所得税。但在实际操作过程中，由于它涉及纳税所属地问题，以及事关各地主管税务机关的任务目标，情况有点复杂，尤其是分公司的规模比较大的时候。 在这样的情况下，理论上的东西都是空的，只有与当地税务机关搞好关系，协调好总公司与分公司的税收分割问题。关系好了，如果不是当年任务完不成，税务机关不会太为难企业。他们一般会要求分公司在当地预缴一部分所得税，然后在总公司汇算清缴时，“多退少补”。 所以，平时报送税务局的报表应做低利润，减少预缴税额，等汇算清缴时，再按实际来申报，尽量规避“多退”的问题（税务局收进去的钱一般不会退回，如果非得退，他们会派人来查帐，那你就等着老板训吧）。情况二、如果是子公司（现在很多人分公司和子公司概念混淆），具有法人资格，一般说来，是就地申报并缴纳所得税。