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你好，合作社一般有免税的政策， 1、直接组织原因不同。公司本质上是商业资本最大限度的追逐利润，追求财富增长而实施扩张的一种进攻行为。合作社则是弱势群体，为了避免可能存在的风险、降低生产成本、满足自己生存地位的一种行为。 2、成员不同。股东加入公司和入社成员加入合作社都是一种自愿的行为，但是合作社的所有者和使用者具有同一性，也就是说成员加入合作社也是为了利用合作社提供的服务，但是公司下的所有者和使用者是分离的，股东通常不需要利用公司的服务。农民专业合作社中成员可以通过合作社购买生产资料，价格会相对便宜。而种子公司的股东并不需要购买种子。 3、组织的目标不同。公司的目的是为了股东的资本增值服务，最终利益实现投资回报率的最大化。合作社的目的是为了成员服务。实现利益共享、风险共担。满足入社成员的需求帮助成员实现生产经营的利润最大化。也算是一种程度的共同富裕。 4、决策的原则不同。合作社属于民主制的组织。合作社内的每个入社成员都有平等的表决权，一般是一人一票。但是公司实行的是一股一票制，也就是说谁拥有的股份多谁的话语权就大。 5、撤出方式不同。公司法不允许股东在公司成立后抽回出资。只能向其他人转让公司的股份。而合作社实行“退社自由”的原则，但却不能将出资额和成员资格转让他人。