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但2019年39号文规定只有旅客运输服务才行抵扣，携程订票是6%订票服务费发票

除了订票服务费还有飞机票的普票

一、关于国内旅客运输服务进项税抵扣 （一）《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号）第六条所称“国内旅客运输服务”，限于与本单位签订了劳动合同的员工，以及本单位作为用工单位接受的劳务派遣员工发生的国内旅客运输服务。 （二）纳税人购进国内旅客运输服务，以取得的增值税电子普通发票上注明的税额为进项税额的，增值税电子普通发票上注明的购买方“名称”“纳税人识别号”等信息，应当与实际抵扣税款的纳税人一致，否则不予抵扣。 （三）纳税人允许抵扣的国内旅客运输服务进项税额，是指纳税人2019年4月1日及以后实际发生，并取得合法有效增值税扣税凭证注明的或依据其计算的增值税税额。以增值税专用发票或增值税电子普通发票为增值税扣税凭证的，为2019年4月1日及以后开具的增值税专用发票或增值税电子普通发票。

所以代订机票服务普通发票不能进行进项抵扣？

对，机票的费用普票可以抵扣

另外如果有了全额开具的代订机票产品的发票，还能再取得行程单吗

一般是拿不到的，你可以再联系下航空公司