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2019年10月5日，某企业申报2019年4-9月的留抵退税，同时也申报了免抵退税。该企业2019年9月的期末留抵税额为100万元。10月20日，税务机关核准其免抵退税应退税额为50万元。11月5日，纳税人完成了纳税申报，且申报了免抵退税，当期期末留抵税额为120万元。11月10日核准留抵退税时，应如何计算留抵退税应退税额？ 解析 11月10日核准留抵退税时，该企业已于11月5日完成了纳税申报，最近一期申报表的期末留抵税额中，已扣减了50万元免抵退税应退税额。根据20号公告第九条第一项规定，因纳税申报、稽查查补和评估调整等原因，造成期末留抵税额发生变化的，按最近一期《增值税纳税申报表（一般纳税人适用）》期末留抵税额确定允许退还的增量留抵税额，因此直接以期末留抵税额120万元为依据，计算留抵退税应退税额。