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一般来说，企业支付给个体工商户佣金是需要缴纳所得税的，按预征税免征的原则，企业发放佣金时应按照6.3%的扣缴率，即个体工商户的税负为5.6%，这属于提前预征的情况。但是，在缴纳个人所得税时，根据《中华人民共和国个人所得税法》第三十四条规定，佣金的扣除标准为5%，因此，企业支付给个体工商户的佣金，有可能会低于提前预征的6.3%，也可能会高于5%的扣除标准。因此，最终缴纳所得税的金额，可能要根据当时具体情况去评估。 此外，个体工商户还可以根据《中华人民共和国个人所得税法》第三十六条规定，按照月度累计扣除规定，将月度累计费用，如专业书籍、出差交通、住宿费等减免在个人所得税中。通过这一措施，可以进一步降低个体工商户的税负。