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基金管理人收取的管理费应纳入企业所得税管理，其申报纳税方式如下： 1. 企业入库登记后，在税务局要求缴纳营业税的情况下，基金管理人应按规定，按月申报缴纳营业税； 2. 基金管理人应将收取的管理费计入收入，并在每月底报送企业所得税年度汇算清缴申报表，并按月计提企业所得税； 3. 将基金管理人收取管理费收入计入本期损益表，在财务报表上作为收入项目，并在企业所得税申报时作为实际应纳税收入明细科目，按月缴纳企业所得税。 税务机关的审核主要是着眼于整体的交税行为：企业是否按期申报、按期缴纳，是否存在漏报、重复申报；企业的税前利润是否合理等。 拓展知识：基金管理人的财务报表估值需要严格按照税务机关规定的会计准则，正确记录管理费收入，正确确定税前利润，以及正确确定应纳税额，从而保证税收管控工作的准确性和合法性。