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是的，分公司可以开具增值税发票，分公司的销项税可以合并到总公司申报增值税，抵扣总公司的进账。 因为分公司的进账的留抵金额都可以合并到总公司，所以分公司可以在开具增值税发票的同时，通过移动联报开具发票，抵扣总公司的进账。而且，分公司开具发票时，不会影响总公司申报增值税的进程，因为所有的票据都是纳入总公司申报增值税的。 另外，有一点很重要的是，分公司开具的发票需要严格遵守国家的相关税收相关规定，确保税收的顺利申报和缴纳。否则，将可能会引起政府的处罚，面临税收的重大损失。