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印花税根据《中华人民共和国税收征收管理法》第四十四条的规定，凡因货物出售、劳务提供等发生的买卖、营业所得，均按照约定的税率缴纳印花税，款项数额在200万以内的，按税率0.05％收纳印花税；款项数额在200万以上的，按税率0.1％收纳印花税。因此，在本次公司购买设备款200万，预付款50万的情况下，仅需按200万的款项数额收纳印花税，即200万*0.1%=20,000元，不用按50万缴纳印花税。 拓展知识：印花税改革主要体现在：一是改革优惠政策，实施社会保险支付减免、社会救助支付减免和就业创业扶持支付减免等政策；二是整合少数税品种，将税种调整为财产（地产）印花税、营业印花税、发票印花税、金融印花税；三是改革征收方式，改变原来的税收征收模式，采取归纳性收税和即征即退机制；四是提高征管效率，实行税收电子化、智能化，提高税务管理的效率和质量；五是营造公平、公正的市场环境，增加税源，稳定税收收入，改善税源结构，促进经济社会可持续发展。