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首先，我们需要根据发票记录的购入的生肉的数量和加工后的熟肉的数量，进行一个调整。根据发票记录，您购入100公斤生肉，加工后只剩60公斤，损耗为40公斤。由于损耗处理，您需要把发票上理论上应缴税费的100公斤重新计算一下，所以您只需要在发票上申报实际购买的60公斤，以及对应损耗，即40公斤，进行税率分类，分别按9%和13%分别进行缴税即可，最终发票上显示的，应缴税额为5.4元（60公斤x13%）+3.6元（40公斤x9%），总计9元。 拓展知识：当纳税人销售熟制品时，如果是加工制作的，只需把加工成品交税，不需要把原料也交税，而在进行加工的中间，有的原材料需要把原材料也交税，比如增值税清单中的税费条目有“板材、型材、钢铁和纤维板等用于生产的原材料”（如果是符合条件的，作为普通商品买卖），这些原材料可以免税，但生肉不在此列，必须按照实际交税。