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苗木普票的进项税进行抵扣，首先要求购买苗木具有可抵扣的进项税，其次应该是实行增值税纳税制度的企业，而且本期应税销售额超过当期可抵扣的进项税额。 在进行抵扣时，需要先将有效的进项税凭证（发票）汇总，根据实际销售额以及可抵扣额计算出抵扣额，将各种发票分类核算，抵扣余额平均分摊在发票上，最后在应税处减免抵扣进项税额，以此实现进项税的抵扣。 此外，在抵扣苗木普票的进项税时，企业应留意政策规定，例如有些林产品受国家控制，禁止购买，或者存在政府支持的专案采购，这类存在特殊性的发票不可作为抵扣凭据，这时候企业可以充分利用企业组织购买根据不同政策参与专案购买时，削减相应的进项税额。 总之，苗木普票的进项税抵扣是一个不可忽视的税收优惠政策，依照相关规定，可以实现合理的减税。企业在抵扣时，应注意政策变化，并在抵扣过程中严格控制发票收集、使用、核算、存档等各个环节，以期最大程度实现进项税抵扣。