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个税申报系统里面本期收入数应按照实际发放的工资进行填报，这里实际发放的工资，是指减去员工交纳的五险一金费用以及缺勤工资后的实际到岗应得金额。据司法解释：“基本工资”不应包含因个人原因（如因缺勤或被扣罚等）而减去的部分。所以个税申报系统里面的本期收入数必须按照实际发放的工资进行填报。 从税务的角度来看，只有全额应得的收入才能够被计入个人所得税计算范围内，所以减去缺勤的部分，或者提取的五险一金的部分，并不在个税的计算范围之内。而且因为不是真正意义上的收入，所以也不应被计算在适用个人所得税税率的基础上。拓展知识：如果员工自愿参加社会保险，那么他们需要支付的社会保险费也不应被计入本期收入数。