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电子专用发票的电子签名有效性验证，主要是通过对签名者的身份进行认证，以及对签名的有效性进行确认。首先对身份认证，需要使用者先完成认证流程，如身份证明，账号验证，信息完整性校验等流程，以确定用户身份。其次就是对签名的有效性进行验证，要确保签名完整有效，无任何被修改的行为，因此可以使用消息摘要算法（如MD5等）采集要签名的信息，并将对信息签名，此签名与用户签名结果进行比对，如果一致，就能够证明用户有效签名。 此外，在数字签名的世界里，还有更多的安全技术来验证和保证电子签名的有效性，比如已知技术如公钥基础设施（PKI），数字证书，时间戳等，它们极大地提高了签名的安全性。