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是的，研发加计扣除负面清单行业可以列研发费用。其中，研发加计抵扣是指符合财政部规定的研发投入的费用，可以从企业所得税中进行抵扣。新出台的《企业所得税法实施条例》明确了以下几点： 一、可抵扣项目：研发投入、研发成果转化费用、技术转让收入、专利合作协议实施费用及相关保理费用； 二、可抵扣行业：在负面清单行业中，可以抵扣研发投入； 三、可抵扣支出：研发人员薪酬、专利费、差旅费、材料费、设备购置费、试验试研费用等； 四、抵扣比例：对于符合财政部规定的研发投入，企业可以在企业所得税中享受抵扣，其中，研发投入抵扣比例最高可达50%，而专利转化费用抵扣比例最高可达75%。 此外，财政部还规定了研发投入抵扣的计算标准，规定增值税销售额大于2万元的企业，研发投入的抵扣标准为税前利润的30%；研发投入抵扣的期限为当年发生的支出；研发投入抵扣的上限为抵扣金额的三倍；并且，企业在进行研发投入抵扣时，需要向财政部出具有效的研发投入凭证。 因此，研发加计扣除负面清单行业可以列研发费用，研发投入抵扣比例上限最高为50%，但企业在申请抵扣时要提供有效证据，并遵守相关规定。拓展知识：研发投入抵扣除了可以抵扣研发费用以外，还可以抵扣研发成果转化费用、技术转让收入、专利合作协议实施费用及相关保理费用等项目的支出。