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您好，很高兴为您解答这个问题。 答：答案是，根据中国税收法规，一个员工在两处都有五千元工资，则其需要补缴个人所得税。因个人收入分所得地税管算，两处的收入均须报送申报，当双方的报税合计工资超过当地规定的应税收入上限，就需要补缴个人所得税。 拓展： 补缴个人所得税有以下几个需要注意的事项： 1、收入的合计是年收入，不是月收入； 2、收入的地域是按照所得地原则确定的，两处收入合计工资超过本地规定应税收入上限，就应该补缴个人所得税； 3、当年拥有两份工作，全年收入都不超过当地规定的应税收入上限，则只需要向各自的所在地纳税； 4、每处的税金都要在所得地正规申报，两处的报税合计均须报送，税务机关将进行综合核查。 以上就是有关一个员工两处都有工资五千，汇算清缴时是否需要补缴个人所得税的详细说明，希望能帮到您。