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欠职工垫付的医药费计入应付职工薪酬科目，垫付的理论上是职工的薪酬，只是职工未能按时领到工资，由公司先行付出，本企业的应付职工薪酬科目是用来记录企业应付职工工资和福利的科目。具体来讲，欠职工垫付的医药费可以记入本企业应付职工薪酬科目，借方记入本企业应付余额，贷方记入个人账户，以待职工按时领取额度。同时，企业还可以纳入社会保险费用中，计入社会保险费应缴纳款科目。 拓展知识：欠职工垫付的医药费除了可以计入应付职工薪酬科目和社会保险费应缴纳款科目外，还可以计入可供出售金融资产、持有至到期投资、长期应收款科目，具体要看财务会计分类账的分析，根据财务实际情况把握，来决定将其分别计入何种科目。