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根据《发票管理办法》以及《发票开具管理规定》规定：收据与发票金额不符的，应以发票金额为准入账，把收据金额按一定的比例抵扣，经有关部门以及会计师审核后，可将收据和发票同时入账。因此，在这种情况下，应按发票金额200元入账。 此外，还要注意的是，发票金额不得超过实际交纳费用金额，否则会被财务审核不通过，影响收入的正确认定。因此，在开具发票时，一定要确保发票金额与实付金额一致，并且发票内容应真实有效，以免造成不必要的麻烦。