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个体工商户开的发票需要缴纳的税的具体数额取决于个体工商户的纳税义务，以及所属的税种。一般来说，个体工商户开出的四万元发票，大致可以分为应纳税款金额和应补（退）税款金额：要支付的应纳税款金额为：增值税：3000元（应纳税额30000元*3%）；个人所得税：2090元（应纳税额30000元*7%）；印花税：200元（应纳金额30000元*0.05%），共计5300元。应补（退）税款金额为：营业税：1000元（应纳税额：30000元*3.5%，税率低于3.5%的可退税）；增值税免抵退税：1000元，共计2000元。综上，个体工商户需要缴纳的税额为5300-2000=3300元。 拓展知识：个体工商户的税负责任取决于个体工商户的纳税义务，也就是说，不同的个体工商户可能需要缴纳不同数量的税款。因此，个体工商户要尽量了解不同类型税种的计算方法和缴纳比例，以便有效缴纳税款，减轻负担。