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发票遗失的情况，原则上是不处理的，因为无法确保原始发票真实性，也无法得到购买方的认可。另外，商业发票是一种重要的法律文书，发票损失不仅会影响企业增值税的纳税义务，还会带来不良法律后果。 因此，最好的做法是要求供应商重新把纸质发票补开，并重新申报增值税。若无法重开，则应采取其他措施确保发票真实性，如与供应商签订协议，当场签字确认；或者单位出具书面证明等方式，来证明发票遗失情况。即使复印件可以勾选认证，也无法得到纳税义务的减免，因此也需要及时处理。 拓展知识：发票遗失后，增值税专用发票也是不具有税费征收减免效力的，因此，如果发票丢失，仍然应缴纳原税款，但是可以在下一个税期内申请税费减免，但要提交有关证明。