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增值税电子专票没有抵扣联的处理： 1、首先，应当核实增值税电子专票是否有效证明：检查发票上明细与销售的明细是否一致，仔细检查开票方、收票方是否正确，是否已经备案，发票号码核实。 2、如果经检查确认其发票有效，没有抵扣联可以将有效发票复印件作为抵扣凭据。 3、如果确认不存在发票有效性问题，应将发票补全税控盘上，重新按照发票规则生成抵扣联，把正确的抵扣联加到发票上进行抵扣。 补充：民间交易也包含增值税，因此，应当将双方签订的交易凭证（如合同）作为增值税义务人的增值税凭据。