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收到科技局打给企业的立项基金应该通过专门的财务会计制度进行做账，以确保财务管理的合法合规。首先，应当按照科技局立项基金的规定，进行台账登记；其次，立项基金的收入应当独立开户登记，严格按照科技局规定的比例完成拨付，并不得挪用；此外，立项基金的支出也应当独立开户登记，且支出的核算要求必须依据实际的开支情况，严格按照科技局规定的目标和指标开支，进行纸质的审批、登记，并保存财务凭证。最后，定期对立项基金的财务状况进行汇总，并上报财政部门予以核实管理。 拓展知识：立项基金不仅要严格遵守财务会计制度，而且还应该加强内部管理，以确保使用的专项基金使用合理、规范合法，尤其是针对支出较大的部分项目，应当制定规章制度，严格审批并保持财务凭证。