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不能抵扣。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》（2002年修订）第十四条规定，企业按照规定发生的运费、保险费增值税销售额不计入计算应税销售额，不予征税。因此，购买存货中运费产生的增值税不能抵扣。 同时，也有一些特殊情况，企业可以申请抵扣增值税，如企业采购货物行销售，开具增值税专用发票，根据相关规定，在购货发票注明收付货款和运费，增值税专用发票中运费产生的税额可以从本期销项发票中抵扣。 总之，根据相关规定，购买存货中运费产生的增值税不能抵扣，有特殊情况的企业也可以申请抵扣。 拓展知识：增值税是指当企业购买原材料、设备等资产时，需要向税务机关缴纳的税种。根据中国的税收法律，企业在支付税款时，若发生的增值税可以根据规定抵扣，则企业可以从缴纳的增值税中抵扣支付税款，以减少企业所要缴纳的税款。