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煤炭企业是可以留底退税的，但是具体退税情况取决于该企业的税务环境。根据《增值税管理办法》的规定，除去规定有免税的项目外，增值税应该由企业上缴，企业可向税务部门申请留底退税，如果税务部门认可，企业每个月就可以获得留底退税，比如上月上缴500,000增值税，可以向税务部门申请留底退税，但该企业还需提供相关发票，以及税务部门的认可，才能得到退税。 此外，有些企业由于纳税义务较低，可以通过税务部门的认可获取免税资格，可以减轻税收负担，避免留底退税麻烦。在这种情况下，企业可以根据税收情况，申请免税资格，以减少税负。