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税务部门在某科研单位月末需要做的实际计算是，使用银行存款缴纳增值税3万元，以及计提的所得税10000元，其中，已计提所得税9000元。 增值税是指增值的税，是指消费者在购买商品和服务时，经营者需按照国家规定的税率缴纳的税。而所得税指的是企业和个人的收入经扣除必要费用后，由纳税人（企业或个人）依照国家规定的税率缴纳的税款。在某科研单位月末，根据税务部门的计算，应当使用银行存款缴纳增值税3万元，以及计提的所得税1万元，其中，已计提所得税9000元。这表明这家科研单位在当月企业收入较多，应当承担缴纳更多的所得税，以履行纳税义务。 拓展知识： 所得税的减免政策是有一定的流程的，比如就某家科研单位而言，当他在缴纳所得税时要按照一定的标准进行计算，如果符合减免条件，就可以从相应税收中获得减免。同时税务部门还会对这家科研单位的交税记录进行定期抽查，对发现的违规行为进行处罚，从而维护国家的财政利益。