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根据国家财政部关于发票使用的规定，农资公司在销售化肥农药等商品时应当为所有客户开具发票，构成税收有效支出的交易都应当开具发票，并及时存入税务系统，保障税收管理的落实，也是保证账务处理的正确完整性。因此，农资公司无论销售的对象是谁，都应当及时开具发票，并将发票存入税务系统。 具体账务处理，步骤如下： 1.在收到客户付款后，农资公司应当及时开具发票，将发票编号录入系统，同时将发票扫描件和相关账务凭证上传税务系统； 2.根据收入类型，将发票细化至财务会计科目，并在收付款过账凭证上加上对应发票号； 3.每月月末，确认发票信息，核实是否存在缺发票的情况，如有，则追发补发，并保存发票及有关凭证，便于税务检查。 此外，税务机关还可以结合多种手段对商品销售的实际情况进行检查，例如走访法、现场检查、纳税检查等，以此确保税收和社会公平。